MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 6897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009484	CGG	2	6	2035754	2035759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_009484	GCT	2	6	2038334	2038339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_009484	CGC	2	6	2040785	2040790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_009484	TCG	2	6	2040803	2040808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_009484	GCC	2	6	2040815	2040820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_009484	CGC	3	9	2040872	2040880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_009484	CCG	2	6	2040882	2040887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_009484	TGC	2	6	2040902	2040907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_009484	CGC	2	6	2040931	2040936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_009484	CGA	2	6	2040943	2040948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_009484	TTCCA	2	10	2040986	2040995	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4012	NC_009484	GGA	2	6	2041063	2041068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_009484	CCGG	2	8	2043273	2043280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_009484	CCGG	2	8	2043291	2043298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_009484	GC	3	6	2046137	2046142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_009484	TCGC	2	8	2046158	2046165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_009484	GTT	2	6	2046169	2046174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_009484	GCA	2	6	2046231	2046236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_009484	GCC	4	12	2046251	2046262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_009484	CG	3	6	2046284	2046289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_009484	ACA	2	6	2046354	2046359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_009484	AGGGA	2	10	2046381	2046390	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_009484	GCA	2	6	2046391	2046396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_009484	CAT	2	6	2047970	2047975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_009484	GCCCT	2	10	2050155	2050164	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4026	NC_009484	CAC	2	6	2052456	2052461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_009484	GCC	2	6	2057492	2057497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_009484	GC	3	6	2057499	2057504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_009484	GC	3	6	2058475	2058480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_009484	CCG	2	6	2059684	2059689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_009484	CGCCGG	2	12	2059695	2059706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_009484	CG	3	6	2059721	2059726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_009484	CAGAA	2	10	2059737	2059746	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4034	NC_009484	GCC	2	6	2059759	2059764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_009484	GC	3	6	2059788	2059793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_009484	TA	3	6	2059831	2059836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_009484	G	6	6	2059844	2059849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_009484	ATC	2	6	2059868	2059873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_009484	GCC	2	6	2064021	2064026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_009484	GC	3	6	2064606	2064611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_009484	CGGG	2	8	2064624	2064631	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_009484	G	6	6	2064629	2064634	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_009484	GGA	2	6	2064673	2064678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_009484	CGC	2	6	2065443	2065448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_009484	ATG	2	6	2065456	2065461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_009484	CGG	2	6	2065479	2065484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_009484	GCGG	3	12	2065481	2065492	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_009484	GCGGG	2	10	2065507	2065516	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4049	NC_009484	CGG	2	6	2065521	2065526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_009484	GCCG	2	8	2065546	2065553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_009484	GAA	2	6	2065571	2065576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_009484	CGG	2	6	2065583	2065588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_009484	A	6	6	2066509	2066514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_009484	ATAA	2	8	2066547	2066554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_009484	TCA	2	6	2066616	2066621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4057	NC_009484	AGCGG	2	10	2067326	2067335	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4058	NC_009484	CG	3	6	2067339	2067344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_009484	GTG	2	6	2067357	2067362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_009484	CGG	2	6	2067373	2067378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_009484	CCGGG	2	10	2069543	2069552	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4062	NC_009484	GCA	2	6	2071100	2071105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_009484	GAC	2	6	2071123	2071128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_009484	GGT	2	6	2071138	2071143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_009484	GCG	2	6	2071585	2071590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_009484	G	6	6	2071590	2071595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_009484	CCG	2	6	2071985	2071990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_009484	CGG	2	6	2074624	2074629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_009484	CGG	2	6	2074651	2074656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_009484	T	6	6	2074670	2074675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_009484	GGC	2	6	2074743	2074748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4075	NC_009484	CAG	2	6	2074836	2074841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4079	NC_009484	GCG	2	6	2075107	2075112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_009484	GGT	2	6	2075199	2075204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_009484	TCG	2	6	2077605	2077610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_009484	TGACG	2	10	2077624	2077633	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4083	NC_009484	GCT	3	9	2077695	2077703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_009484	GCGG	2	8	2077704	2077711	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4085	NC_009484	CGG	2	6	2077772	2077777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_009484	GTG	3	9	2077795	2077803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_009484	GC	3	6	2077856	2077861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_009484	GCC	2	6	2077875	2077880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_009484	GC	3	6	2077933	2077938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_009484	GGA	2	6	2077950	2077955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4092	NC_009484	TCG	2	6	2078051	2078056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_009484	CG	3	6	2078064	2078069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_009484	GGC	2	6	2078070	2078075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4097	NC_009484	CG	3	6	2078137	2078142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_009484	GGC	3	9	2078148	2078156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_009484	GC	4	8	2078171	2078178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_009484	CGA	2	6	2078181	2078186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_009484	CG	3	6	2078193	2078198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_009484	CGG	2	6	2078202	2078207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_009484	CAGCGG	2	12	2078208	2078219	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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4107	NC_009484	CGA	2	6	2080113	2080118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_009484	CGC	2	6	2080122	2080127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_009484	GGC	2	6	2080143	2080148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_009484	T	7	7	2080158	2080164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_009484	CG	3	6	2080183	2080188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_009484	GTT	2	6	2080206	2080211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_009484	CTGGGC	2	12	2080215	2080226	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_009484	GCG	2	6	2080240	2080245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4116	NC_009484	TCT	2	6	2080283	2080288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4120	NC_009484	TGC	2	6	2080474	2080479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_009484	CGGGT	2	10	2080490	2080499	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4122	NC_009484	CGG	3	9	2080533	2080541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_009484	GGC	2	6	2080542	2080547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_009484	CGTC	2	8	2080554	2080561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_009484	CGGCG	2	10	2080575	2080584	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4126	NC_009484	GC	3	6	2080601	2080606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_009484	GC	3	6	2082482	2082487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_009484	G	6	6	2082490	2082495	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_009484	ATC	2	6	2082563	2082568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_009484	GCG	2	6	2084241	2084246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_009484	CCCG	2	8	2085848	2085855	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4133	NC_009484	CG	3	6	2085854	2085859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4134	NC_009484	GC	3	6	2087927	2087932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4254	NC_009484	CCGT	2	8	2169184	2169191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4257	NC_009484	GC	3	6	2172800	2172805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_009484	CGG	2	6	2172816	2172821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_009484	CCGG	2	8	2172835	2172842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4260	NC_009484	CGCC	2	8	2172845	2172852	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4261	NC_009484	GGC	2	6	2172873	2172878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4392	NC_009484	ATC	2	6	2219635	2219640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4393	NC_009484	GCC	2	6	2219661	2219666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4394	NC_009484	GA	3	6	2219695	2219700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4395	NC_009484	CGA	2	6	2219831	2219836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4396	NC_009484	GGC	2	6	2219840	2219845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4398	NC_009484	TCC	2	6	2219928	2219933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4401	NC_009484	CCA	2	6	2223346	2223351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4413	NC_009484	C	6	6	2237747	2237752	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4416	NC_009484	CAT	2	6	2238009	2238014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4417	NC_009484	ATCCG	2	10	2238079	2238088	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4418	NC_009484	CG	3	6	2238617	2238622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4420	NC_009484	CCGGT	2	10	2238687	2238696	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4423	NC_009484	GGC	2	6	2242815	2242820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4427	NC_009484	CG	3	6	2243846	2243851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4431	NC_009484	GTCCG	2	10	2243985	2243994	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4432	NC_009484	TCCGG	2	10	2244034	2244043	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4433	NC_009484	TGC	2	6	2244071	2244076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4435	NC_009484	CGA	2	6	2250396	2250401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4452	NC_009484	GTC	2	6	2266312	2266317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4473	NC_009484	GCC	2	6	2275047	2275052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4481	NC_009484	CG	3	6	2283991	2283996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4482	NC_009484	CGGC	2	8	2284013	2284020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4483	NC_009484	TCCGT	2	10	2289530	2289539	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4484	NC_009484	CG	3	6	2289545	2289550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4485	NC_009484	GC	3	6	2289551	2289556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4486	NC_009484	CGC	3	9	2289554	2289562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4487	NC_009484	T	7	7	2289595	2289601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4488	NC_009484	T	6	6	2289656	2289661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4489	NC_009484	CCG	2	6	2289706	2289711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4490	NC_009484	GTTTC	2	10	2289739	2289748	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4491	NC_009484	ATC	2	6	2289754	2289759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4492	NC_009484	CGC	2	6	2289789	2289794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4493	NC_009484	CCACG	2	10	2289810	2289819	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4494	NC_009484	GCCG	2	8	2289826	2289833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4495	NC_009484	GCCCGC	2	12	2289839	2289850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4496	NC_009484	CGA	2	6	2289859	2289864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4497	NC_009484	GCC	2	6	2290916	2290921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4498	NC_009484	ATC	2	6	2290923	2290928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4499	NC_009484	GTC	2	6	2291004	2291009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4500	NC_009484	GCA	2	6	2291027	2291032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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